Raphaël Pichon commence son apprentissage musical à travers le violon, le piano et le chant. Jeune chanteur, il se produit sous la direction de Jordi Savall, Gustav Leonhardt, Ton Koopman ou encore au sein des Cris de Paris de Geoffroy Jourdain.
En 2006, il fonde Pygmalion, chœur & orchestre sur instruments d’époque. Parmi les projets marquants de ces dernières années, citons la création de Trauernacht sur des musiques de Bach, mise en scène par Katie Mitchell (2014), la redécouverte de l’Orfeo de Rossi à l’Opéra national de Lorraine et à l’Opéra royal de Versailles (2016), les Vêpres de la Vierge avec Pierre Audi (Holland Festival, BBC Proms, Chapelle royale de Versailles, Festival Bach de Leipzig), une version scénique d’Un requiem allemand par Jochen Sandig dans la base sous-marine de Bordeaux, les productions scéniques de La Flûte enchantée par Simon McBurney (2018), du Requiem de Mozart avec Romeo Castellucci (2019) et de Samson, libre création autour de l’opéra perdu de Rameau, avec Claus Guth (2024) au Festival d’Aix-en-Provence, de Lakmé (2022) et de L’Autre Voyage sur des musiques de Schubert (2024) à l’Opéra-Comique.
En 2020, il crée le festival Pulsations à Bordeaux. À partir de 2024, il entame avec Pygmalion le projet Les Chemins de Bach, grand voyage à pied et à vélo entre Arnstadt et Lübeck.
Comme chef invité, Raphaël Pichon dirige le Freiburger Barockorchester, Musicaeterna, la Scintilla de l’Opéra de Zürich, la Handel and Haydn Society de Boston, le Mozarteum Orchester, et dernièrement l’Orchestra of St. Luke’s au Carnegie Hall. La saison 2025-2026 marque ses débuts à l’Opéra de Paris ainsi qu’avec les Berliner Philharmoniker et avec l’orchestre du Concertgebouw d’Amsterdam.
Ses enregistrements sont publiés sous le label harmonia mundi (Libertà! autour de chefs-d’œuvre méconnus de Mozart, les Motets, la Passion selon saint Matthieu et la Passion selon saint Jean, ainsi que la Messe en si de Bach, les Vêpres de la Vierge de Monteverdi, le Requiem de Mozart…).
Raphaël Pichon est officier dans l’Ordre des Arts et des Lettres.
